martes, 22 de septiembre de 2015

En primer árbol integral de la vida muestra cómo está relacionada a millones de especies



¿Quiere saber cómo usted puede relacionar a una wombat? O una ameba? Ahora usted puede, gracias al Árbol Abierto de la Vida, recientemente publicado que teje más de 500 árboles de la familia de los diversos grupos de organismos para crear un super-árbol con 2,3 millones de especies.

Los investigadores ya han comenzado a poner estos nuevos datos para trabajar hacia una mejor comprensión de la vida en la Tierra. "Todo lo que se estudia en la biología se puede fijar en algún lugar del árbol de la vida", dice James Rosindell, biólogo computacional en el Imperial College de Londres, que no participó en la base de datos. "Es muy significativo que los científicos finalmente hayan producido un árbol completo."

Durante los últimos 3 años, cerca de 35 personas de 11 laboratorios de Estados Unidos han gastado alrededor de 100.000 horas recorriendo la literatura científica de árboles genealógicos. Tenían que resolver cuestiones de nomenclatura, a veces una especie tendrían varios nombres, y en un momento de un oso hormiguero espinoso compartían el mismo apodo con una morena, confundiendo las computadoras. "No hay una sola base de datos de nombres aceptados, por lo que el grupo tenía que llegar a uno", dice el co-autor Douglas Soltis, biólogo evolutivo de la Universidad de Florida, Gainesville.

Él y sus colegas esperan tejer juntos estos diferentes árboles de la familia que a menudo no estaban de acuerdo, esta sería la parte difícil. Pero lo que les dejó perplejo era la escasez de la mayoría de datos digitalizados. De 7500 árboles publicados entre 2000 y 2012, sólo uno de cada seis estaban computarizados. En última instancia, el equipo utilizó los árboles pequeños alrededor de 500, para construir uno grande, dice Karen Cranston, una bióloga evolutivo de la Universidad de Duke en Durham, Carolina del Norte, que ayudó a coordinar el esfuerzo. Con este relativamente pequeño tamaño de la muestra, el proyecto de árbol, publicado en línea este mes en las Actas de la Academia Nacional de Ciencias, "no resume lo que sabemos", dice Cranston.

Pero el sitio web del árbol incluye enlaces a los estudios originales examinadas que ofrecen puntos de vista alternativos, añade. Además, el sitio está construido para aceptar la retroalimentación e incorporar nuevos datos que finalmente se utiliza para actualizar el árbol. "Esperamos que el árbol se vea muy diferente en un año a partir de ahora", añade Cranston.

Mientras tanto, Rosindell y Yan Wong, biólogo evolutivo en el Museo de la Universidad de Oxford de Historia Natural, se han adaptado de una herramienta informática que han estado desarrollando para ayudar a la gente "ver" el árbol. Se llama OneZoom, el proyecto que funciona como Google Maps en el que un usuario puede desglosar el tronco del árbol, ramas, y consejos para ver los detalles cada vez más finos. En este video, OneZoom comienza con una descripción general del árbol, luego se acerca en las ramas sucesivamente más detalladas que conducen primero a los animales, a continuación, a los soportes placentarios de los mamíferos, y, finalmente, a los seres humanos. Para este árbol, Wong utiliza no sólo los datos Abrir árbol, sino también datos de otros estudios que identificó como importantes.

"Es una visualización genial", dice Abrir Árbol de la Vida y coordinador biólogo evolutivo Stephen Smith, de la Universidad de Michigan, Ann Arbor. Él espera que habrá muchas más adaptaciones de los datos. Si usted puede combinar con otros datos, por ejemplo, "usted puede hacer su propio árbol de la vida."

Publicado en Biología, Medio Ambiente  SCIENCE AAAS